Tóm tắt nội dung

Với mục tiêu xây dựng thành công Cytoscape App tính toán HC và Biomarker gene. Đề tài Phát triển ứng dụng Cytoscape tìm Hierarchical closeness và Biomarker Genes của mạng lưới quy mô lớn bằng thuật toán song song trên Java đã thực hiện xây dựng các chức năng cơ bản của một Cytoscape App; công nghệ thiết kế Cytoscape App bằng Java; cách lập trình song song trên CPU và GPU bằng java. Ứng dụng Maven Project vào xây dựng phần mềm. Kết quả nghiên cứu được trình bày trong 3 chương, gồm: Chương 1: Tổng quan về nội dung nghiên cứu; Chương 2: Cơ sở lý thuyết; Chương 3: Nội dung và kết quả đồ án. Trên cơ sở của kết quả nghiên cứu liên quan, đề tài đã xây dựng thành công Cytoscape App tính toán HC và Biomarker gene. Nắm bắt được các kiến thức về Java, Maven Project, lập trình song song, v.v. Ứng dụng, phát triển được công nghệ thiết kế Cytoscape App bằng Java.

Từ khóa:

Cytoscape, Hierarchical closeness, Biomarker Genes, Thuật toán song song

Abstract:

With the goal of successfully building Cytoscape App to calculate HC and Biomarker genes. The project Development of Cytoscape applications for Hierarchical closeness and Biomarker Genes of large-scale networks using parallel algorithms on Java has implemented the basic functions of a Cytoscape App; Cytoscape App design technology in Java; how to program in parallel on CPU and GPU using java. Apply Maven Project to build software. Research results are presented in 3 chapters, including: Chapter 1: Overview of research content; Chapter 2: Theoretical Foundations; Chapter 3: Contents and results of the project. Based on the relevant research results, the project has successfully built the Cytoscape App to calculate HC and Biomarker genes. Gain knowledge of Java, Maven Project, parallel programming, etc. Apply and develop Cytoscape App design technology in Java.

Key word:

Cytoscape, Hierarchical closeness, Biomarker Genes, Parallel Algorithms